يتضمن الجزء الأول من هذه الموسوعة – بعد المقدمة والمدخل – تاريخ مدرسة الرسول الأكرم “صلى الله عليه وآله وسلم” وأهل البيت”عليهم السلام” في مكة والمدينة والكوفة، وهي المرحلة التأسيسية للبناء العلمي للحوزات العليمة؛ ومنها تبرعمت وأثمرت الحوزات العلمية الأخرى.